More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1074 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  73.98 
 
 
257 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  63.2 
 
 
261 aa  289  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  48.97 
 
 
247 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  46.99 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  50.81 
 
 
293 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  46.48 
 
 
260 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  45.68 
 
 
252 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  47.64 
 
 
253 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.94 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  45.75 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  49.58 
 
 
244 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
248 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  45.45 
 
 
253 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  48.72 
 
 
244 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  43.37 
 
 
260 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
287 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  46 
 
 
262 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  45.08 
 
 
252 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  45.45 
 
 
259 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  43.37 
 
 
258 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
267 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
255 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  43.32 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  46.69 
 
 
257 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  46.25 
 
 
243 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 
259 aa  188  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  43.85 
 
 
262 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  43.85 
 
 
255 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 
261 aa  184  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  44.26 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  43.33 
 
 
259 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 
252 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 
253 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  44.26 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  43.09 
 
 
257 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  40.07 
 
 
270 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
253 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  44.17 
 
 
253 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 
252 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  45.1 
 
 
255 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 
256 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  45.68 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  42.91 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  42.39 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  44.54 
 
 
254 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  41.09 
 
 
263 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 
252 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 
270 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  44.36 
 
 
246 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  47.06 
 
 
253 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 
269 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  42.92 
 
 
253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  42.92 
 
 
253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  43.02 
 
 
255 aa  176  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 
263 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  41 
 
 
258 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
268 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.39 
 
 
264 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
258 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  44.13 
 
 
269 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  42.04 
 
 
250 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 
258 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  42.04 
 
 
250 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  42.5 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  43.44 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  41.92 
 
 
251 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 
269 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  43.7 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 
247 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 
247 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>