More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1760 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 253 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  58.23 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  53.78 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  50.19 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  47.79 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  49.06 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  46.74 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  46.24 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  46.24 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  47.66 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  48.06 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  49.62 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  47.13 
 
 		 265 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  46 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  44.44 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  46.77 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  48.21 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  47.35 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  47.64 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  44.66 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  45.45 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  45.78 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.66 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  46.83 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  46.09 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  44.88 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 269 aa  188  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  43.24 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 249 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  42 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  43.44 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  43.24 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  43.24 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  44.84 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  41.8 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  44.22 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>