More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04835 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  75.38 
 
 
259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  68.36 
 
 
256 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  64.73 
 
 
287 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  58.59 
 
 
259 aa  319  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  60.55 
 
 
259 aa  316  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  58.2 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  56.92 
 
 
258 aa  304  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  50.38 
 
 
293 aa  259  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 
263 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  41.86 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
259 aa  218  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 
252 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 
265 aa  214  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 
258 aa  214  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 
272 aa  211  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  41.09 
 
 
259 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
281 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
281 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.01 
 
 
271 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.7 
 
 
265 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  43.37 
 
 
265 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.55 
 
 
265 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.11 
 
 
264 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
255 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 
255 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.94 
 
 
250 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  36.43 
 
 
270 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
247 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  40.61 
 
 
258 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
253 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
258 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 
262 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
251 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.45 
 
 
258 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
252 aa  185  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
259 aa  182  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 
253 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
248 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  38.8 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 
257 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 
252 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
263 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  39.11 
 
 
255 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
249 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
249 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
249 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
249 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 
250 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  39.04 
 
 
250 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
252 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.95 
 
 
248 aa  175  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
256 aa  174  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.08 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  38.31 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
249 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
259 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
249 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 
247 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  37.35 
 
 
250 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
246 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
257 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
248 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
269 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  36.05 
 
 
259 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.02 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  34.25 
 
 
250 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  34.25 
 
 
250 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  36.43 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  34.54 
 
 
251 aa  165  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>