More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2311 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  100 
 
 		 279 aa  557  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  52.22 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  46.51 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.91 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  44.96 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  47.88 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.13 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  47.88 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 249 aa  185  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  40.38 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.18 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  43.46 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  42.8 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  44.23 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  41.09 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  43.02 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  41.09 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 245 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  43.41 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  43.41 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  43.85 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 		 252 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 251 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  42.31 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  44.06 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  41.38 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  39.46 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  41.09 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  41.94 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 261 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  39.15 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  45.04 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  41.31 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  41.31 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  41.86 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  40.53 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>