More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1351 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 256 aa  533  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  68.36 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  64.03 
 
 		 259 aa  353  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  62.26 
 
 		 259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  60.24 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  61.96 
 
 		 255 aa  315  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  56.57 
 
 		 259 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  57.81 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  54.26 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  45.1 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  40.39 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 		 265 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  40.78 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.1 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 257 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.97 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  37.92 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  38 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  37.2 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.82 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.8 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  33.98 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 		 265 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  35.34 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  35.34 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>