More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1272 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
265 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  62.84 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  60.15 
 
 
261 aa  331  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  51.41 
 
 
263 aa  259  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  48.85 
 
 
263 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 
260 aa  242  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  49.21 
 
 
264 aa  225  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  47.04 
 
 
264 aa  225  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  47.43 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  47.79 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  47.04 
 
 
264 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  46.43 
 
 
242 aa  204  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  40.45 
 
 
265 aa  190  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  42.58 
 
 
264 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 
266 aa  186  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 
260 aa  185  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 
265 aa  184  9e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  41.67 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.64 
 
 
257 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 
252 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 
247 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 
250 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
260 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  40.53 
 
 
277 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
252 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  39.55 
 
 
255 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
262 aa  158  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  38.28 
 
 
260 aa  158  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 
269 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.65 
 
 
264 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 
259 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 
254 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  37.6 
 
 
252 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
255 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
255 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  39.68 
 
 
258 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
255 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
287 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
253 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
280 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  36.43 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 
264 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  42.47 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  37.04 
 
 
251 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
251 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  37.59 
 
 
255 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.39 
 
 
293 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  39.04 
 
 
252 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 
255 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  35.83 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.11 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  37.59 
 
 
258 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 
252 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 
253 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 
263 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
254 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
254 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
248 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  39.06 
 
 
255 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
254 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
253 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2962  stationary-phase survival protein SurE  37.55 
 
 
267 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0657042 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  30.98 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  33.72 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 
248 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  38.28 
 
 
255 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.26 
 
 
259 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  30.98 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  38.67 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  32.16 
 
 
257 aa  139  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
254 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
252 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  36.23 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
253 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.1 
 
 
257 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  38.58 
 
 
263 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
252 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
265 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
251 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.15 
 
 
250 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
256 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.15 
 
 
250 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>