More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2962 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2962  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0657042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.96 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  34.19 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  35.11 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  37.87 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  36.67 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  35.87 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  34.19 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  34.35 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  32.85 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  35.58 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.82 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  33.45 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  32.86 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  31.54 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  35.51 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  37.12 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  33.58 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  35.23 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  32.02 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  31.6 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  30.97 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  32.31 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  30.42 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  29.62 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  34.06 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  32.71 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  32.71 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  32.21 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  32.34 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  34.47 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  31.25 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  29.55 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  33.71 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  34.07 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  29.24 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  34.64 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  32.35 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  42.65 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  29 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  32.71 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  32.71 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  29.45 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  28.04 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  32.35 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  27.53 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  29.06 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  29.81 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  31.77 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  28.47 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  31.73 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  32 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  31.62 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  30.25 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  27.65 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  33.45 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  28.89 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  32.84 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  32.34 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  30.37 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  34.56 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  32.83 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  34.56 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  36.32 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  31.18 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  31.91 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  29.37 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  31.73 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  29.39 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  30.74 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  28.84 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  31.23 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>