More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3740 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  47.86 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  47.46 
 
 		 247 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  45.64 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  44.77 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  43.57 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  45.92 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  44.81 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  50.22 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  49.78 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  49.78 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  43.43 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 252 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  43.28 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  39.17 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  45.42 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  42.44 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  43.22 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  38.75 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 265 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  44.68 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  42.56 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  42.56 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  42.86 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 252 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  43.64 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  41 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  44.12 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  39.18 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  40.85 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 248 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  43.88 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  41.42 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  39.77 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40.43 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  37.92 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  37.24 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  42.5 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  41.98 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  40.34 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  38.17 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>