More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1313 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  58.91 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  57.2 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 
258 aa  294  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  52.9 
 
 
258 aa  280  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  52.9 
 
 
258 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  54.44 
 
 
257 aa  270  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  49.43 
 
 
263 aa  268  8e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  52.9 
 
 
258 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 
250 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
247 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
249 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 
249 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 
252 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
252 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
248 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.69 
 
 
250 aa  178  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
246 aa  178  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.4 
 
 
258 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
249 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 
262 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  35.97 
 
 
248 aa  174  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
251 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
259 aa  174  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
250 aa  174  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
248 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.34 
 
 
245 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 
251 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  34.51 
 
 
250 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  34.51 
 
 
250 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
254 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
263 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
254 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  33.99 
 
 
254 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 
250 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
255 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
254 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 
248 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
251 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 
251 aa  168  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 
258 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
251 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  35.69 
 
 
257 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
255 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
253 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  36.76 
 
 
246 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
255 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
253 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
255 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 
247 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 
253 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
260 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 
257 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
253 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
255 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
249 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  35.57 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 
268 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  34.12 
 
 
253 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  34.12 
 
 
253 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 
258 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 
258 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 
255 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 
258 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  34.27 
 
 
261 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 
272 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>