More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1575 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  78.43 
 
 
256 aa  427  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  60.78 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 
257 aa  294  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  58.14 
 
 
263 aa  287  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 
258 aa  286  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 
257 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  54.55 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  53.67 
 
 
264 aa  259  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.47 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
248 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
247 aa  191  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
252 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
261 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 
250 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 
273 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
259 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
263 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 
257 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.36 
 
 
258 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 
254 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
263 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
250 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 
251 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 
253 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
251 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
254 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
258 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 
289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
249 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  37.7 
 
 
250 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  36.19 
 
 
251 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 
251 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  37.7 
 
 
250 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
250 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
249 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
254 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
254 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 
249 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.04 
 
 
259 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
249 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
249 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 
259 aa  168  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
249 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
249 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
249 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
249 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  38.34 
 
 
263 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 
261 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.74 
 
 
245 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
254 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
280 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 
248 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
260 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
248 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  35.43 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
251 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
252 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
249 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
249 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
252 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
249 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
253 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
253 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
256 aa  164  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.8 
 
 
248 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  34.66 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  37.45 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>