More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1160 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
260 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  82.31 
 
 
289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  82.44 
 
 
263 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  83.92 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  76.28 
 
 
253 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  75.2 
 
 
252 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  74.71 
 
 
261 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  75.88 
 
 
261 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  66.53 
 
 
253 aa  328  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  64.66 
 
 
257 aa  328  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  63.83 
 
 
252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  61.67 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  62.5 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  62.5 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  62.29 
 
 
252 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  62.98 
 
 
252 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  63.14 
 
 
253 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  62.71 
 
 
253 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  58.63 
 
 
250 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  61.44 
 
 
253 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  61.09 
 
 
250 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  61.44 
 
 
253 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  62.29 
 
 
253 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  60.33 
 
 
253 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  60.33 
 
 
253 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  60.33 
 
 
253 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  60.33 
 
 
253 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  61.02 
 
 
253 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  60.59 
 
 
253 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  60.59 
 
 
253 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  60.59 
 
 
253 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  60.59 
 
 
253 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  57.32 
 
 
255 aa  288  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  60.59 
 
 
253 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  52.67 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  54.01 
 
 
247 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  57.87 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  57.14 
 
 
246 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
249 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
249 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  49.19 
 
 
250 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  49.19 
 
 
250 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 
248 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  49.38 
 
 
251 aa  244  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  51.05 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  49.2 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  53.11 
 
 
257 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  49.2 
 
 
249 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  51.25 
 
 
249 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  51.25 
 
 
249 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  51.25 
 
 
249 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  51.05 
 
 
252 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  50.83 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  50 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  50.81 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  49.58 
 
 
251 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
248 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  51.49 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 
249 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  48.8 
 
 
249 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  52.24 
 
 
258 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  47.2 
 
 
249 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  44.75 
 
 
258 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0835  stationary phase survival protein SurE  56.96 
 
 
247 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.153163  normal  0.263072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  50.39 
 
 
258 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  46.8 
 
 
249 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  44.75 
 
 
258 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  51.25 
 
 
250 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  50.41 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  48.62 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  52.44 
 
 
251 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 
249 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  50.42 
 
 
249 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  50.42 
 
 
249 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
249 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  50.98 
 
 
263 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  45.2 
 
 
248 aa  225  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  47.92 
 
 
249 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  47.35 
 
 
246 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  48.36 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 
255 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  47.81 
 
 
253 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  48.56 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
262 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  47.15 
 
 
262 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  49.17 
 
 
256 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  48.32 
 
 
247 aa  218  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  45.06 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17450  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 
249 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>