More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0325 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
256 aa  530  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  63.92 
 
 
256 aa  332  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  60.78 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  57.2 
 
 
257 aa  306  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  56.54 
 
 
263 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  53.1 
 
 
258 aa  288  4e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  53.1 
 
 
258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  52.33 
 
 
258 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  50.78 
 
 
257 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  52.29 
 
 
264 aa  258  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  39.06 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
253 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.22 
 
 
258 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 
258 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 
248 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.94 
 
 
252 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.28 
 
 
263 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
248 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
250 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
249 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
251 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 
252 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.74 
 
 
245 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
254 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
254 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 
259 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
254 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 
249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
249 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 
254 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 
259 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
249 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
251 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
249 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
249 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  35.04 
 
 
257 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
252 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
248 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 
260 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 
253 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  34.24 
 
 
255 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  34.51 
 
 
253 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
252 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  34.51 
 
 
253 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  34.24 
 
 
255 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
247 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
252 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  35.27 
 
 
250 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
252 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  35.27 
 
 
250 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 
251 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 
255 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  34.24 
 
 
255 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
257 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 
259 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
251 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  34.38 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 
269 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  34.65 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 
261 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
249 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
252 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  34.39 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  37.11 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
250 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  34.63 
 
 
251 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 
253 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>