More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1381 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 257 aa  526  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  80.39 
 
 		 258 aa  428  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  80 
 
 		 258 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  79.61 
 
 		 258 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  55.25 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  54.44 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  50.78 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  49.43 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  49.04 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  41.41 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  35.46 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.94 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.04 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  37.89 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  35.71 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  37.94 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  34.9 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  34.9 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  34.26 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  34.26 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  34.52 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  34.52 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  34.52 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.11 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  33.99 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  34.24 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  35.12 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0835  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.153163  normal  0.263072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  33.86 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  36.54 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.89 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.54 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>