More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5133 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  98.07 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  92.66 
 
 		 259 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  92.66 
 
 		 259 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  92.66 
 
 		 259 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  92.28 
 
 		 259 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  89.58 
 
 		 259 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  60 
 
 		 259 aa  314  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  56.54 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  58.69 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  45.24 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  47.83 
 
 		 258 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  45.45 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  46.09 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  44.18 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  44.88 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  44.18 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  47.83 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  47.83 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  44.88 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  43.31 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  44.13 
 
 		 254 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  44.94 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  45.34 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  44 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  43.57 
 
 		 254 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  45.78 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  43.93 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  32.67 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  32.67 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  34.26 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.69 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 262 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 248 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.52 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  32.67 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  37.07 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  34.69 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 253 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.25 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  32.51 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  33.73 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.71 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>