More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4019 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  67.32 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  69.41 
 
 		 261 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  60.39 
 
 		 259 aa  317  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  60.39 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  60 
 
 		 273 aa  314  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  59.22 
 
 		 259 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  59.22 
 
 		 259 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  59.22 
 
 		 259 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  59.36 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  45.85 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  45.85 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  47.52 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  45.45 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  45.42 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  44.66 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  46.18 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  46.03 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  46.91 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  47.92 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  42.35 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  42.39 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  45.88 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  43.32 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  42.56 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  40.83 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.76 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  38.24 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  40.76 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  31.98 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  31.98 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  31.98 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  41.42 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  35.46 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  34.52 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  34.98 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  37.21 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  33.97 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  37.21 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  35.34 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  35.34 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  31.17 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  36.54 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  35.14 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 289 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  35.97 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.93 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  32.4 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>