More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2784 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  97.65 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  87.8 
 
 		 255 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  85.88 
 
 		 255 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  83.92 
 
 		 255 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  78.74 
 
 		 255 aa  427  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  76.38 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  63.14 
 
 		 253 aa  328  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  64.34 
 
 		 254 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  64.34 
 
 		 254 aa  328  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  62.75 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  63.35 
 
 		 280 aa  325  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  63.93 
 
 		 254 aa  324  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  64.75 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  61.57 
 
 		 252 aa  316  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  57.25 
 
 		 277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  59.38 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  57.81 
 
 		 258 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  58.75 
 
 		 255 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  58.37 
 
 		 266 aa  289  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  56.98 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  57.25 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  56.59 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 		 256 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  51.95 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  50.79 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  48.16 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  45.45 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  45.28 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  46.61 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  47.43 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  46.06 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 273 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  44.88 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  44.22 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  45.28 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  41.44 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  41.44 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  41.44 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 250 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  41.34 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  41.34 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  39.62 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.5 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.16 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.55 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  38.08 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  42.06 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.04 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  41.56 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  43.5 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>