More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2664 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  77.78 
 
 		 256 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  74.5 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  74.5 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  66.93 
 
 		 255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  66.54 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  65.74 
 
 		 252 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  67.33 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  57.42 
 
 		 254 aa  294  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  57.42 
 
 		 254 aa  294  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  56.69 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  55.47 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  58.02 
 
 		 253 aa  284  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  57.2 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  56.25 
 
 		 252 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  57.68 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  55.12 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  55.91 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 		 255 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  54.9 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  54.44 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  56.91 
 
 		 255 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  51.94 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  52.55 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  54.17 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  53.94 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  52.72 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  48.15 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.72 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  44.18 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  42.58 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  43.93 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  37.31 
 
 		 250 aa  182  7e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  42.68 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  41.49 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  42.15 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.39 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  42.97 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.74 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  36.64 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.27 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.66 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  38.98 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>