More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1769 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  51.88 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  50 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  51.26 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  51.25 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  51.68 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 253 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  50.4 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  49.21 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  48.81 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  48.81 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  51.26 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  48.41 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  49.8 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  49.21 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  49.18 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  47.6 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  50.21 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  47.28 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  51.87 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  46.46 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  48.81 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  48.97 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  46.44 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  46.91 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  50.83 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  48.03 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  50 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  47.58 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  47.58 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  47.58 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  47.92 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  47.08 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  44.18 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  43.5 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 248 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  41.87 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  42.62 
 
 		 248 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  42.51 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 249 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  42.34 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.98 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  41.87 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  42.44 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  43.1 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  41.09 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  43.93 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  41.84 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  43.51 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  45.63 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  43.1 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  43.1 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  42.68 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  45.57 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>