More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0199 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 263 aa  544  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  57.3 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  56.54 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  58.17 
 
 		 256 aa  295  7e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  58.14 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  49.43 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  47.91 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  47.53 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  49.43 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  47.53 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  43.24 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  43.63 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.93 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.23 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  40.46 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.58 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.62 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.62 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.46 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  40.3 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  40.84 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  40.75 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  39.54 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  39.08 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  40.3 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  41.7 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  36.15 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  39.08 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  38.72 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>