More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1536 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  57.3 
 
 
263 aa  308  5e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  55.13 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  48.46 
 
 
258 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  53.67 
 
 
258 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  48.08 
 
 
258 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  52.29 
 
 
256 aa  258  6e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  49.04 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  48.46 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 
248 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
252 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.46 
 
 
257 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
253 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 
259 aa  174  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 
259 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.16 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  41 
 
 
250 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
263 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.46 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.23 
 
 
250 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.23 
 
 
250 aa  168  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.64 
 
 
251 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  38.08 
 
 
254 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  38.85 
 
 
255 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.46 
 
 
248 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 
251 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
250 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
247 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 
249 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 
249 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 
249 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.08 
 
 
248 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  40.6 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  40.77 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
248 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 
257 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 
259 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  38.49 
 
 
252 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38.95 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 
246 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  40.84 
 
 
253 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.84 
 
 
259 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  37.64 
 
 
255 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
248 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
252 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
248 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  36.64 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  36.64 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
252 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 
254 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.79 
 
 
251 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
249 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 
249 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 
252 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
253 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
253 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
253 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 
251 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  39.41 
 
 
265 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 
257 aa  158  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
247 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
253 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  39.78 
 
 
265 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
253 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 
261 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  37.16 
 
 
250 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  37.17 
 
 
270 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 
261 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
251 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 
251 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 
250 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
280 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
249 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 
251 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  36.74 
 
 
264 aa  155  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 
254 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>