More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0721 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  62.4 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  54.17 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  48.43 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  52.92 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  52.57 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  48.61 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  47.24 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  46.25 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  46.25 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  50.79 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  50.2 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  50.99 
 
 		 255 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  49.81 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  45.06 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  48.33 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  48.33 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  48.4 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  50.42 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  46.94 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  46.61 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  46.61 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  45.82 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  44.76 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  44 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  44.31 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  43.6 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  44.22 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  43.03 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  44.19 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 247 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  40.7 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.18 
 
 		 248 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  42.92 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  41.06 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  40.73 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  41.76 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  41.76 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  40.07 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  45.6 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  40.93 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  42.63 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.94 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  41.91 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 251 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  40.83 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  41.86 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.92 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  42.75 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.52 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>