More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1399 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  62.8 
 
 
250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  63.87 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  60.89 
 
 
250 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  59.92 
 
 
259 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  54.94 
 
 
257 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
250 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39.18 
 
 
255 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 
259 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 
252 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  39.69 
 
 
265 aa  185  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  41.09 
 
 
261 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  36.59 
 
 
255 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.26 
 
 
259 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
252 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
271 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
272 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
270 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 
260 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.56 
 
 
264 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
268 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
269 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  36.43 
 
 
265 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
269 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
262 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.51 
 
 
252 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 
254 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  37.19 
 
 
269 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.62 
 
 
248 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 
258 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 
269 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  37.14 
 
 
255 aa  168  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.05 
 
 
260 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
259 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  40.95 
 
 
262 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
259 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
262 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 
258 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  34.45 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
265 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
253 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  37.13 
 
 
259 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
257 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 
257 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  35.95 
 
 
258 aa  161  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  39.05 
 
 
269 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  38.55 
 
 
257 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.66 
 
 
248 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.91 
 
 
250 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 
255 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  35.51 
 
 
263 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  158  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 
293 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
247 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 
249 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
252 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.42 
 
 
248 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  39.06 
 
 
263 aa  156  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  35.34 
 
 
247 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  42.65 
 
 
269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 
287 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
253 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 
254 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
253 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
251 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
256 aa  155  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
251 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
253 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 
253 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
250 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  40.54 
 
 
270 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  37.69 
 
 
258 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 
258 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  36.43 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 
255 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 
252 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
253 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 
258 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  40.5 
 
 
252 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 
255 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  36.25 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>