More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3515 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 287 aa  593  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  62.75 
 
 		 259 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  64.73 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  60.24 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  61.24 
 
 		 259 aa  316  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  61.24 
 
 		 259 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  59.45 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  59.06 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  51.22 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  43.92 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  43.18 
 
 		 263 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  44.09 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 258 aa  212  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  42.62 
 
 		 256 aa  210  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  45 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  41.32 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  43.57 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  38.17 
 
 		 265 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 271 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  39.06 
 
 		 258 aa  175  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 255 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40.41 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  39.06 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  38.67 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.31 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  40.68 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  38.15 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  39.34 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  37.16 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  37.2 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  37.22 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  36.43 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  37.07 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.72 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  32.8 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.94 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 249 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  44.26 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>