More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1090 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 250 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  79.12 
 
 		 269 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  75.51 
 
 		 259 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  60.89 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  59.51 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  58.66 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  48.39 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.31 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  39.83 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  42.04 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  39.04 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.5 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  38.17 
 
 		 265 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  41.84 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  38.14 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  37.97 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  39.17 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.87 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  36.89 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  43.31 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  35.92 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  36.48 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  40.78 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  42.63 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  37.14 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  39.24 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  36.68 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  37.14 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  37.14 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  39.5 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  39.51 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  38.82 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  37.89 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>