More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0401 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 258 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  85.83 
 
 		 265 aa  471  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  81.78 
 
 		 258 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  81.5 
 
 		 259 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  80.56 
 
 		 272 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  75.49 
 
 		 257 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  72.83 
 
 		 263 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  48.82 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  44.14 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  42.25 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  40.94 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  42.52 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  41.04 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  41.04 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  40.89 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  41.89 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 281 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  39.02 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  41.86 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.64 
 
 		 265 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  39.09 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  41.4 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.58 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  36.36 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.13 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 249 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.34 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  38.98 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>