More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1665 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 258 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  70.47 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  67.84 
 
 		 259 aa  357  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  59.06 
 
 		 287 aa  310  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  56.92 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  56.64 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  57.81 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  55.17 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  51.74 
 
 		 293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  41.73 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  43.89 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.49 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  43.37 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  39.17 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  40.33 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.26 
 
 		 265 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  37.01 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  34.51 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 261 aa  156  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  38.27 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  38.27 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.19 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  38.68 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  38.04 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  36.11 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  34.94 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.25 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>