More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7059 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  58.59 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  61.24 
 
 		 287 aa  316  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  56.57 
 
 		 256 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  57.54 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  57.59 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  56.64 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  57.71 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  48.05 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  40.8 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  43.41 
 
 		 265 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  42.63 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 265 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  43.27 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  43.32 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  43.04 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  41.1 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  39.18 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  39.06 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  39.36 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.42 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.66 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  34.14 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.63 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.83 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  35.41 
 
 		 270 aa  165  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 		 251 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 		 253 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  37.92 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  35.22 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  36.43 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.69 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  36.74 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.99 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>