More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0021 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  79.12 
 
 		 250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  76.49 
 
 		 259 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  60.32 
 
 		 250 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  62.55 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  58.75 
 
 		 257 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  46.37 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.67 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  38.27 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  38.7 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  38.31 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  37.32 
 
 		 293 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 265 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 258 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 249 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  38.67 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  36.18 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.09 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.14 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  36.57 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  34.73 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  35.5 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.28 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.42 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>