More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1167 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  97.57 
 
 
247 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  56 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  53.97 
 
 
259 aa  289  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 
252 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  46.9 
 
 
258 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  46.75 
 
 
255 aa  224  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  45.91 
 
 
259 aa  221  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  44.92 
 
 
270 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  46.59 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  44.8 
 
 
264 aa  214  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.47 
 
 
281 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.47 
 
 
281 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  46.44 
 
 
293 aa  208  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  40.77 
 
 
271 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  46.34 
 
 
260 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 
251 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  43.6 
 
 
255 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  45 
 
 
252 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  45.12 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  42.41 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  42.41 
 
 
265 aa  198  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
253 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
257 aa  191  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  39.04 
 
 
259 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 
252 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
255 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
269 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  41.15 
 
 
255 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
269 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 
248 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  38.62 
 
 
250 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
254 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
258 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 
259 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 
252 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
265 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 
247 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  40.49 
 
 
260 aa  179  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  38.15 
 
 
269 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
262 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
259 aa  178  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
251 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  43.97 
 
 
265 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 
254 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 
257 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
269 aa  175  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
269 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  43.78 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.31 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
256 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
269 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
246 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
254 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  34.82 
 
 
248 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.76 
 
 
257 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  37.66 
 
 
280 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
261 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 
256 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  35.22 
 
 
247 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  39.42 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  38.62 
 
 
250 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
255 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  40 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  39.66 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>