More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1365 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  52.17 
 
 
255 aa  262  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  50.19 
 
 
253 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  46.99 
 
 
270 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  48.65 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  48.26 
 
 
257 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  47.31 
 
 
260 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  46.42 
 
 
271 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  45.52 
 
 
281 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  45.52 
 
 
281 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  46.62 
 
 
265 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  44.74 
 
 
268 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  45.08 
 
 
258 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  45.25 
 
 
259 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  45.67 
 
 
252 aa  222  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  46.9 
 
 
247 aa  221  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  46.51 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  44.36 
 
 
265 aa  219  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  43.53 
 
 
250 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.63 
 
 
255 aa  201  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 
250 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  44.19 
 
 
251 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  41.41 
 
 
293 aa  194  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  41.26 
 
 
269 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 
247 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  40.61 
 
 
260 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  42.91 
 
 
255 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
256 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  39.53 
 
 
270 aa  188  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 
254 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  41 
 
 
269 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
259 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 
262 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
248 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 
262 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 
258 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  39.78 
 
 
269 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 
259 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  42.35 
 
 
255 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 
269 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.25 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  40.7 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.08 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  40.71 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 
259 aa  182  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
259 aa  181  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  41.25 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  43.53 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  42.91 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  42.29 
 
 
269 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
254 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
251 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 
252 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 
251 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 
248 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  44.04 
 
 
262 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
263 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
254 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 
252 aa  175  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  43.58 
 
 
262 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  39.85 
 
 
257 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36.22 
 
 
258 aa  175  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 
269 aa  175  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  40.87 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.45 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  37.21 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  40.15 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
250 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  40.3 
 
 
259 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  39.15 
 
 
250 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
249 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  37.12 
 
 
263 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 
255 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 
248 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  42.31 
 
 
262 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
273 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
249 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  41.54 
 
 
253 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  40 
 
 
254 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
287 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  37.35 
 
 
250 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 
250 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>