More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1955 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
293 aa  597  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  50.38 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  50.98 
 
 
259 aa  268  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  54.26 
 
 
256 aa  263  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  51.22 
 
 
287 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  49.42 
 
 
265 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  49.21 
 
 
258 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  48.66 
 
 
259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  48.82 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  47.29 
 
 
263 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  51.36 
 
 
259 aa  250  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  51.74 
 
 
258 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  48.02 
 
 
272 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  48.41 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  49.61 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  48.4 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  48.05 
 
 
259 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  50.61 
 
 
260 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  48.21 
 
 
248 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  45.74 
 
 
259 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  47.22 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  47.22 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  49 
 
 
253 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  50.81 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  45.78 
 
 
255 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 
255 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  50 
 
 
257 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 
268 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  42.75 
 
 
264 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  46.43 
 
 
262 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  45.02 
 
 
253 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 
255 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  43.35 
 
 
270 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  46.44 
 
 
247 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  43.97 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  44.18 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  41.41 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  40.37 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  42.16 
 
 
281 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  42.16 
 
 
281 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.8 
 
 
252 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  45.61 
 
 
247 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  45.38 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  43.3 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  41.83 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  41.83 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
246 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  42.64 
 
 
263 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  42 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
249 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  44.18 
 
 
251 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 
249 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 
249 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
252 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
248 aa  191  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  41.77 
 
 
248 aa  191  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
249 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
249 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  41.49 
 
 
259 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  43.31 
 
 
250 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  41.76 
 
 
265 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
248 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 
249 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
254 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
254 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
249 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  44.58 
 
 
254 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
249 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  40.46 
 
 
258 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
249 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  43.37 
 
 
245 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
249 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  46.4 
 
 
248 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 
247 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  43.19 
 
 
253 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  46 
 
 
248 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
255 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 
249 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  42.58 
 
 
255 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  43.14 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  42.51 
 
 
261 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 
251 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  41.98 
 
 
257 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 
249 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
249 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>