More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0837 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  98.85 
 
 
262 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  78.93 
 
 
269 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  74.33 
 
 
269 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  73.18 
 
 
269 aa  410  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  72.8 
 
 
269 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  72.8 
 
 
269 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  73.56 
 
 
269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  73.75 
 
 
269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  73.56 
 
 
269 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  53.78 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  53.78 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  51.55 
 
 
258 aa  270  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
271 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  52.14 
 
 
265 aa  259  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  50.58 
 
 
268 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  50.61 
 
 
270 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  51.74 
 
 
265 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.8 
 
 
259 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  45.75 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  45.16 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 
253 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  47.2 
 
 
252 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 
253 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  42.17 
 
 
255 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 
257 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  40.31 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 
255 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 
252 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  41.41 
 
 
254 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  43.37 
 
 
258 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  41.57 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 
251 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 
247 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
251 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  43.06 
 
 
250 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
247 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
247 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  44.04 
 
 
258 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  41.86 
 
 
258 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 
248 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 
257 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  40.39 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
262 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  40.58 
 
 
272 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  41.47 
 
 
259 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  41.71 
 
 
263 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
255 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
255 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 
250 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  41.7 
 
 
263 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  40.95 
 
 
259 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 
248 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
259 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
250 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
258 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 
255 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  42.68 
 
 
265 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 
262 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 
262 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
251 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.43 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  41.23 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  36.58 
 
 
247 aa  165  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  43.66 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  38.55 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  35.91 
 
 
252 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
265 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  38.06 
 
 
254 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 
248 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
251 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
259 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  36.76 
 
 
259 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
258 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  41.23 
 
 
254 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
258 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  35.91 
 
 
252 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
246 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  36.51 
 
 
259 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 
252 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
251 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.67 
 
 
250 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
257 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 
249 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  40.76 
 
 
254 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  37.8 
 
 
257 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  41.31 
 
 
280 aa  158  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  40.28 
 
 
254 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  36.4 
 
 
252 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>