More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1491 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
257 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  98.44 
 
 
257 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  72.44 
 
 
256 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  74.5 
 
 
256 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  68.25 
 
 
258 aa  354  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  66.53 
 
 
252 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  66.67 
 
 
255 aa  347  8e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  66.27 
 
 
266 aa  345  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  57.14 
 
 
252 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  57.71 
 
 
254 aa  291  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  57.71 
 
 
254 aa  291  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  55.51 
 
 
263 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  57.75 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  57.36 
 
 
255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  55.51 
 
 
253 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  54.94 
 
 
254 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  56.59 
 
 
255 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  56.42 
 
 
255 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  54.33 
 
 
253 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  56.76 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  54.18 
 
 
280 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  55.92 
 
 
255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  52.33 
 
 
277 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  56.91 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
269 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  49.8 
 
 
264 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  46.44 
 
 
261 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  48.33 
 
 
273 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  45.27 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.39 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  40.87 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  40.71 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  41.11 
 
 
259 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  40.83 
 
 
259 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 
252 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.56 
 
 
262 aa  184  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  40.71 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  42.75 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 
250 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.74 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 
260 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
251 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  38.11 
 
 
250 aa  176  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.7 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41.22 
 
 
258 aa  171  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
259 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 
252 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
248 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 
248 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
247 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
264 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 
261 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.28 
 
 
257 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 
261 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
260 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 
250 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  37.2 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 
256 aa  166  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  38.74 
 
 
261 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.11 
 
 
258 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 
255 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
258 aa  165  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.26 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  41.39 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 
251 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  41.39 
 
 
253 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
251 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  38.06 
 
 
251 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
259 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 
255 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
258 aa  162  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  34.54 
 
 
262 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  34.54 
 
 
262 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  41.02 
 
 
251 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 
258 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
252 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 
269 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 
258 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  40.62 
 
 
251 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 
254 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  37.85 
 
 
250 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  37.85 
 
 
250 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  35.16 
 
 
255 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 
253 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 
253 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>