More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4752 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  93.7 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  93.7 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  87.7 
 
 		 254 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  85.32 
 
 		 253 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  84.52 
 
 		 253 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  68.65 
 
 		 252 aa  357  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  65.35 
 
 		 280 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  63.78 
 
 		 263 aa  348  7e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  63.93 
 
 		 255 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  63.93 
 
 		 255 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  61.81 
 
 		 255 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  61.48 
 
 		 255 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  62.3 
 
 		 255 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  59.61 
 
 		 255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  61.48 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  58.26 
 
 		 277 aa  308  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  56.52 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  57.71 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  57.31 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  56.13 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  55.47 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  55.34 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  53.56 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  52.57 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  52.28 
 
 		 269 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  48.41 
 
 		 261 aa  242  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  45.06 
 
 		 273 aa  231  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  43.43 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  44.58 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  44.53 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  44.53 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  44.53 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  44.4 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  43.03 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  42.47 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 		 261 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.4 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 		 263 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.9 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.41 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  40.25 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.17 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.74 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  41.74 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  40.83 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 258 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  40.66 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  39.53 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  39.75 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.41 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  38.17 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  41.84 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>