More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1792 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  89.02 
 
 
255 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  81.5 
 
 
255 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  78.74 
 
 
255 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  78.74 
 
 
255 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  78.35 
 
 
255 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  77.17 
 
 
255 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  62.7 
 
 
253 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  62.7 
 
 
253 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  60.78 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  60.78 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  59.61 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  62.3 
 
 
254 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  59.84 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  58.91 
 
 
263 aa  299  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  58.44 
 
 
252 aa  295  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  53.15 
 
 
277 aa  289  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  56.98 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  56.59 
 
 
266 aa  281  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  56.2 
 
 
258 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  55.29 
 
 
252 aa  272  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  54.3 
 
 
256 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  56.91 
 
 
257 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  56.91 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  52.55 
 
 
256 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  52.71 
 
 
269 aa  261  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  51.45 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  46.46 
 
 
261 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  46.64 
 
 
273 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  47.95 
 
 
254 aa  225  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  44.88 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  43.14 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  43.48 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  42.39 
 
 
259 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  42.35 
 
 
259 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  41.96 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  41.96 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  41.96 
 
 
259 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  41.18 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  42.59 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 
247 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  42.69 
 
 
261 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 
261 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 
252 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 
253 aa  181  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 
261 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  42.06 
 
 
254 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 
262 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
263 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  41.32 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 
248 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.23 
 
 
257 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.33 
 
 
248 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  42.02 
 
 
255 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  40.55 
 
 
250 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 
250 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.82 
 
 
258 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  40.55 
 
 
250 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
252 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
252 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
258 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 
248 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
258 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
258 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  42.06 
 
 
249 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
262 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  38.85 
 
 
265 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
262 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  34.38 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  39.67 
 
 
245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 
259 aa  165  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.4 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.32 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  35.77 
 
 
250 aa  162  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 
249 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
260 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.3 
 
 
251 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  42.5 
 
 
280 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 
254 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
254 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.25 
 
 
258 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 
259 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  39.3 
 
 
254 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 
249 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.25 
 
 
258 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1129  stationary phase survival protein SurE  40.89 
 
 
249 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436835  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 
251 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  39.04 
 
 
248 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 
257 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.76 
 
 
259 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1562  stationary-phase survival protein SurE  40.49 
 
 
249 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.511421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 
253 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>