More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1775 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  89.02 
 
 		 255 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  75.98 
 
 		 255 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  76.38 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  75.59 
 
 		 255 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  75.98 
 
 		 255 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  75.2 
 
 		 255 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  63.93 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  63.93 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  62.7 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  61.48 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  62.7 
 
 		 280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  62.3 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  62.3 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  60.16 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  58.44 
 
 		 252 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  59.53 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  59.14 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  58.37 
 
 		 258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  51.97 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  55.86 
 
 		 256 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  54.9 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  55.92 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  55.92 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  53.12 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  51.04 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  49.38 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  46.85 
 
 		 259 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  48.16 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  45.74 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  46.06 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  46.09 
 
 		 273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  43.08 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  45.14 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  43.97 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  43.14 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  45.06 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.22 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  43.32 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  41 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  41.3 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  41.98 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  39.25 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  43.44 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  40.65 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  40.74 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  43.44 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  38.49 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  39.51 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  41.32 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  42.28 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.25 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  40.38 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  39.09 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  39.09 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  42.86 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  41.27 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1129  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  40.82 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  41.32 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  43.75 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.67 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  41.32 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.1 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  41.53 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>