More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1791 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  68.06 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  64.86 
 
 		 261 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  64.09 
 
 		 261 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  63.46 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  65.89 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  64.09 
 
 		 261 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  46.83 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  43.95 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  44.22 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  42.25 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  43.51 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  44.19 
 
 		 273 aa  197  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  42.59 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  43.43 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  42.02 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  43.3 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  41.8 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  43.63 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  43.24 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  41.25 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  41.22 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  40.8 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  40 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  40.55 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  42.91 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  35.25 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  43.15 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  37.02 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  35.5 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  35.45 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  37.74 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  35.66 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.54 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  33.71 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  34.08 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  34.62 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  35.5 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  34.87 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  34.11 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.25 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  35.82 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  34.36 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  35 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  34.72 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  34.98 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  34.23 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  34.72 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  34.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  32.68 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  35.52 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  34.38 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  37.85 
 
 		 247 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  34.35 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  35.93 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  36.94 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  33.84 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  32.68 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  30.53 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  35.25 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  32.59 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>