More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1802 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  71.71 
 
 		 258 aa  367  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  70.12 
 
 		 266 aa  364  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  70.52 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  66.53 
 
 		 257 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  66.14 
 
 		 257 aa  351  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  65.34 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  65.74 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  56.52 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  55.56 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  55.08 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  55.73 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  55.29 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  56.13 
 
 		 277 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  54.15 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  54.15 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  55.12 
 
 		 263 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  57.61 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  55.29 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  54.4 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  55.29 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  53.15 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  52.57 
 
 		 254 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  52.96 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  52.17 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  51.26 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  50.21 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  50.42 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  45.88 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  46.25 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  46.85 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  44.44 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  45 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  43.65 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  45.04 
 
 		 247 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  42.46 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  46.64 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  43.2 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  43.39 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  40.39 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  42.56 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  41.83 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  41.32 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  43.33 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.44 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  44.27 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  41.9 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  43.87 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  37.11 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  42.98 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  43.39 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  41.86 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  39.3 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  41.47 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  41.47 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  42.51 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  42.28 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  41.37 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 255 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  40.71 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>