More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2188 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  72.62 
 
 
267 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  60.15 
 
 
265 aa  331  7.000000000000001e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  50.39 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  50.96 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  54 
 
 
260 aa  267  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  52.44 
 
 
279 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  47.67 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  49.21 
 
 
264 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  50.19 
 
 
264 aa  229  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  48.82 
 
 
264 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  50.45 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.47 
 
 
257 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  40.8 
 
 
265 aa  184  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
260 aa  177  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
252 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.69 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.38 
 
 
260 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
247 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 
266 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  38.61 
 
 
248 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  41.6 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  38.29 
 
 
263 aa  163  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  34.98 
 
 
265 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
264 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
265 aa  160  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
252 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 
251 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.47 
 
 
250 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 
262 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 
255 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  36.58 
 
 
252 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
253 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
255 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
257 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  40.4 
 
 
252 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  37.31 
 
 
258 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
252 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
253 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
253 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 
257 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  38.82 
 
 
250 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  35.53 
 
 
258 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  38.82 
 
 
250 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  38.43 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  36.9 
 
 
293 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
287 aa  151  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  35.25 
 
 
255 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  42.13 
 
 
252 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 
259 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
252 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  35.46 
 
 
250 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
259 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
269 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
269 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
259 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  35.6 
 
 
258 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  35.69 
 
 
259 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
256 aa  149  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.22 
 
 
260 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.88 
 
 
255 aa  148  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
258 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 
269 aa  148  9e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
263 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  37.84 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  35.38 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  39.61 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
255 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
253 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  37.14 
 
 
265 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 
269 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  35.14 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  33.98 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  37.89 
 
 
259 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
248 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  35.38 
 
 
272 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  35.41 
 
 
269 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>