More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1004 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  45.77 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  49.58 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  46.67 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  48.13 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  42.45 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  41.67 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  43.33 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  38.04 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  40.42 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  35.47 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.63 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  35.23 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  39.09 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  39.17 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  34.1 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.18 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  36.08 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.27 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  39.34 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  35.04 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1952  stationary-phase survival protein SurE  37.34 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.19 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  34.96 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  36.93 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  36.51 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  35.11 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  34.98 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  36.21 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  35.38 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  34.68 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  35.95 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.66 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  34.46 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  33.99 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  36.48 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  35 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  32.08 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  36.84 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  31.92 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.61 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  36.21 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  34.15 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>