More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0405 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  79.41 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  75.53 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  64.05 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  49.37 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  45.75 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  43.85 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  40.98 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  41.46 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  40.96 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  43.67 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  42.5 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  44.49 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  40.34 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  40.25 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.34 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  39.83 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  39.42 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  39.42 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 265 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 269 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  37.31 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  36.47 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.5 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  39.51 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  40.57 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.93 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38.91 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  37.7 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.21 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  37.76 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  37.66 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  37.21 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  36.95 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  37.1 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 		 287 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  38.33 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  41.1 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  40.51 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  38 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.11 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  37.82 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>