More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1203 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  63.93 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  64.05 
 
 		 244 aa  310  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  58.68 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  48.8 
 
 		 257 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  49.58 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  45.68 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  42.21 
 
 		 252 aa  177  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  43.85 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.25 
 
 		 262 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  41.87 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.56 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  43.03 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  38.33 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  49.16 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  41.42 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  39.59 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  38.25 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  42.92 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  40.76 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  40.48 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  39.83 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  40.53 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  38.33 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 260 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  41.56 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  42.15 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  39.15 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  39.68 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  41.32 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  39.33 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 		 271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  38.84 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  40.91 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  39.22 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  38.31 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  39.2 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  38.76 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  38.21 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  37.86 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  39.37 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  39.45 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  38.87 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.08 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  39.09 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  39.51 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 265 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>