More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0582 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  75.1 
 
 
260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  72.37 
 
 
263 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  70.23 
 
 
279 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  55.98 
 
 
263 aa  298  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  51.52 
 
 
267 aa  271  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  50.39 
 
 
261 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  51.41 
 
 
265 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  46 
 
 
264 aa  198  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  45.82 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  45.42 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 
260 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 
264 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  41.76 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  41.92 
 
 
257 aa  175  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  44.8 
 
 
242 aa  174  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  41.7 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
265 aa  171  9e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
266 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
264 aa  165  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.62 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
262 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
248 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.56 
 
 
260 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  37.9 
 
 
252 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 
247 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 
252 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
252 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  40.64 
 
 
253 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  37.85 
 
 
252 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 
250 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 
255 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  37.02 
 
 
264 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.17 
 
 
257 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  38.26 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.54 
 
 
253 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  36.02 
 
 
270 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 
253 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  37.7 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  37.6 
 
 
245 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  36.94 
 
 
258 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 
253 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  39.44 
 
 
253 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
252 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
253 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  39.29 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  37.88 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
251 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.25 
 
 
263 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  37.07 
 
 
248 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  37.21 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  35.74 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  36.88 
 
 
252 aa  145  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
252 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
249 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 
249 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.54 
 
 
258 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
249 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  38.25 
 
 
249 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 
257 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.32 
 
 
258 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  35.88 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.32 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.69 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  35.52 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  32.59 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  34.31 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.94 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  36.26 
 
 
258 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 
248 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  37.05 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  37.97 
 
 
250 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  37.45 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  36.4 
 
 
253 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  34.98 
 
 
259 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>