More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1385 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  74.81 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  72.37 
 
 
263 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  68.87 
 
 
279 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  59.92 
 
 
263 aa  305  6e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  56.54 
 
 
267 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  50.96 
 
 
261 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  48.85 
 
 
265 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  46.42 
 
 
264 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  47.64 
 
 
264 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  48.03 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  46.04 
 
 
264 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  44.96 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  41.18 
 
 
260 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  44.59 
 
 
242 aa  178  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  41.09 
 
 
265 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  38.02 
 
 
265 aa  169  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  41.63 
 
 
252 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
253 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
263 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  37.74 
 
 
264 aa  159  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 
262 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.71 
 
 
247 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  42.57 
 
 
253 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 
260 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  43.78 
 
 
252 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
252 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.31 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
248 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
250 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  41.13 
 
 
253 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 
253 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 
255 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  38.58 
 
 
287 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 
253 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 
253 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 
253 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 
251 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.5 
 
 
258 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
252 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
251 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  40.4 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  32.69 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  36.26 
 
 
270 aa  145  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
253 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.7 
 
 
293 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 
258 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 
253 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
251 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  37.89 
 
 
251 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  36.19 
 
 
259 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  36.96 
 
 
259 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  36.88 
 
 
260 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
251 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  38.37 
 
 
250 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  36.74 
 
 
263 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  38.43 
 
 
250 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  38.43 
 
 
250 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  37.89 
 
 
257 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
263 aa  141  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  37.69 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  36.84 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  37.3 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
248 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
255 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  39 
 
 
248 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  36.98 
 
 
261 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.77 
 
 
257 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
255 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  38.26 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.32 
 
 
265 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  36.69 
 
 
250 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
249 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.26 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  37.59 
 
 
256 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  34.62 
 
 
259 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>