More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0305 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  80.53 
 
 
265 aa  442  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  71.97 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  69.47 
 
 
264 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  48.13 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  40.45 
 
 
265 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  41.76 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  38.78 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  39.85 
 
 
279 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  34.98 
 
 
261 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
255 aa  158  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
259 aa  158  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
263 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  36.88 
 
 
256 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  37.35 
 
 
260 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  37.65 
 
 
265 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 
258 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  39.02 
 
 
259 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 
258 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 
264 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  38.34 
 
 
260 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  38.85 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 
259 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 
252 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  40.5 
 
 
257 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
264 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  36.23 
 
 
257 aa  139  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  40.24 
 
 
293 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0222  stationary phase survival protein SurE  37.17 
 
 
242 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
258 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
259 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 
252 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
250 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  36.65 
 
 
258 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  32.37 
 
 
270 aa  132  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.12 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 
248 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  37.4 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  39.17 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  35.09 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.22 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  35.15 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  36.59 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.64 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  33.71 
 
 
281 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  33.71 
 
 
281 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0936  stationary-phase survival protein SurE  37.02 
 
 
253 aa  125  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.371275  normal  0.06931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  33.73 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 
253 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  36.74 
 
 
250 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  36.1 
 
 
249 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  36.69 
 
 
252 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  34.54 
 
 
259 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0040  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
261 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  34.73 
 
 
253 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  36.3 
 
 
251 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  34.66 
 
 
257 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
248 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  37.2 
 
 
259 aa  122  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  35.08 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  35.39 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  33.85 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  35.08 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1952  stationary-phase survival protein SurE  38.5 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
253 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
253 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
253 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
253 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
247 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
253 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  35.06 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  33.33 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  37.4 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
254 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  36.99 
 
 
280 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  34.94 
 
 
252 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  38.06 
 
 
254 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  34.72 
 
 
256 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  34.27 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>