More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1952 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1952  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  69.11 
 
 		 249 aa  345  4e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0936  stationary-phase survival protein SurE  65.85 
 
 		 253 aa  330  9e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.371275  normal  0.06931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1981  5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase / exopolyphosphatase  67.21 
 
 		 250 aa  322  4e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  35.32 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  37.34 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  38.5 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  39.42 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  39.01 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  37.33 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  36.45 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  36.07 
 
 		 252 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  34.57 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.18 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  36.28 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  34.72 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  38.5 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  33.19 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  31.34 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  34.29 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  33.48 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  34.2 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  31.85 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  37.73 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  35.56 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  33.59 
 
 		 277 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  35.44 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  36.28 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  36.82 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  34.6 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  33.64 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  34.08 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  32.23 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  31.58 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  33.04 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  32.72 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  32.31 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  35.32 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  35.32 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  32.88 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  34.08 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  31.86 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  35.12 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  33.04 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  34.84 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  35.35 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  32.74 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  31.1 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  32.42 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  34.93 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  34.84 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  33.65 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  34.76 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  36.24 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  33.94 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  32.23 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  36.04 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  31.13 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  31.13 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  32.74 
 
 		 253 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  31.53 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  33.48 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  34.3 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  33.17 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  33.93 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  35.44 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  36.04 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  32.11 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  34.95 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  34.39 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  33 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  32.74 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  32.41 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  31.39 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  33.5 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  32.9 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  32.9 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  29.46 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  33.67 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  29.41 
 
 		 270 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  31.02 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  32.69 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  33.83 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>