More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1981 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1981  5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase / exopolyphosphatase  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1952  stationary-phase survival protein SurE  67.21 
 
 
246 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0881  stationary-phase survival protein SurE  66.8 
 
 
249 aa  329  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.704956  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0936  stationary-phase survival protein SurE  64.4 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.371275  normal  0.06931 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
270 aa  168  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  34.58 
 
 
265 aa  122  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  35.45 
 
 
252 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  37.44 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.33 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  35.12 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 
248 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  34.43 
 
 
264 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  34.31 
 
 
266 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  38.73 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  35.64 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.41 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.16 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.16 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  36.27 
 
 
280 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.64 
 
 
247 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  31.05 
 
 
252 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  35.96 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  35.84 
 
 
259 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  35.62 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  39.01 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  38.01 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0752  stationary-phase survival protein SurE  33.48 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00127492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  33.91 
 
 
257 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  33.96 
 
 
265 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
246 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  40.44 
 
 
259 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  31.67 
 
 
269 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  36.19 
 
 
250 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  37.13 
 
 
247 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  38.54 
 
 
280 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  32.86 
 
 
258 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  38.54 
 
 
260 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
265 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  35.24 
 
 
259 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  32.85 
 
 
262 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  35.32 
 
 
246 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  32.85 
 
 
262 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
265 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  38.12 
 
 
263 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  34.12 
 
 
259 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  30.7 
 
 
248 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
270 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  36.7 
 
 
248 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  35.56 
 
 
261 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  32.72 
 
 
255 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  32.55 
 
 
265 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  35.56 
 
 
254 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  31.7 
 
 
258 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  32.57 
 
 
259 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  33.49 
 
 
257 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  35.75 
 
 
254 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  36.28 
 
 
257 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  39.47 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0753  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.817205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  35.56 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  36.41 
 
 
289 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  31.4 
 
 
269 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  35.24 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  34.3 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  36.41 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  31.58 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  38.12 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  34.3 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  35.12 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  31.72 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  34.2 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  34.2 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  33.02 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  30.45 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  32.61 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  32.38 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  33.19 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  33.02 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  32.55 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  31.39 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  36.92 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  37.8 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  32.89 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  32.9 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  32.55 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  31.56 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  33.03 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  36.67 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  31.4 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  31.9 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  34.42 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  30.3 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  34.65 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>