More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1068 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
263 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  68.06 
 
 
260 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  66.41 
 
 
261 aa  355  5e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  62.98 
 
 
261 aa  343  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  62.98 
 
 
261 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  64.5 
 
 
261 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  58.94 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  44.62 
 
 
254 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  43.08 
 
 
254 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 
254 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  43.8 
 
 
255 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  41.51 
 
 
253 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  41.9 
 
 
253 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
254 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  41.92 
 
 
254 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  41.76 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  39.23 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 
255 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  39.54 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  42.19 
 
 
255 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  39.23 
 
 
273 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  42.97 
 
 
255 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  39.16 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
264 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  40.78 
 
 
255 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  39.69 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  39.69 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  39.69 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  40.54 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
263 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  38.49 
 
 
269 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  38.64 
 
 
255 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  39.39 
 
 
258 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  38.26 
 
 
266 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  39.92 
 
 
252 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  39.69 
 
 
255 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  38.93 
 
 
252 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
256 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  37.79 
 
 
256 aa  162  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  39.06 
 
 
259 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  39.78 
 
 
270 aa  158  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  34.6 
 
 
258 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  34.6 
 
 
258 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  35.82 
 
 
263 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  37.01 
 
 
257 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  35.88 
 
 
260 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
256 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 
248 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 
258 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  33.84 
 
 
258 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  38.46 
 
 
259 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  33.96 
 
 
249 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  34.96 
 
 
256 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  39.16 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  33.96 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  34.48 
 
 
259 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  36.78 
 
 
255 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 
257 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.94 
 
 
259 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 
250 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
252 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
249 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  33.96 
 
 
248 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  35.77 
 
 
255 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  34.34 
 
 
249 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
249 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  34.59 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  35.61 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.31 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  32.56 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  35.16 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  35.88 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  35.38 
 
 
253 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  35.09 
 
 
249 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  33.97 
 
 
259 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
245 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  33.21 
 
 
248 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  32.44 
 
 
250 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 
249 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0804  stationary phase survival protein SurE  37.64 
 
 
254 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  34.08 
 
 
256 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  31.78 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0800  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0219037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  32.95 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  32.17 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>