More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1562 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1562  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.511421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  93.57 
 
 		 249 aa  477  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1129  stationary phase survival protein SurE  87.45 
 
 		 249 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  80.57 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  83.4 
 
 		 249 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  83 
 
 		 249 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  83.4 
 
 		 249 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  81.38 
 
 		 249 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1514  stationary phase survival protein SurE  79.12 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17450  stationary phase survival protein SurE  80.16 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  75.2 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  56.1 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  55.69 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  54.29 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  53.06 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1824  stationary phase survival protein SurE  52.24 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  53.25 
 
 		 245 aa  258  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  53.44 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  52.23 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  52.03 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  52.44 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  52.03 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  51.22 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  52.03 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  52.85 
 
 		 249 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  52.44 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  48.57 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  52.03 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  54.66 
 
 		 256 aa  254  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  52.03 
 
 		 249 aa  254  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  51.63 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  51.63 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  53.88 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  50.61 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  49.59 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  53.78 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  51.41 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  54.29 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  54.29 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  53.01 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2418  stationary phase survival protein SurE  54.03 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  49 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  50.8 
 
 		 259 aa  244  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  51.43 
 
 		 253 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  51.43 
 
 		 253 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1357  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.526205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1119  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1847  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0713117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  52.44 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  52.99 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0495  stationary phase survival protein SurE  50.61 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.319446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  51.43 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  51.22 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1450  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135797 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  51.43 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  51.43 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  48.58 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  49.19 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  47.2 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5124  stationary phase survival protein SurE  51.02 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  51.84 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  50.41 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  49.59 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  49.39 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  49.6 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  48.8 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  47.62 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  48.79 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  48.39 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  47.35 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  48.98 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  45.53 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  48.78 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  47.74 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  49.4 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  49 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  49 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  49 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  49 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  48.59 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>