139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1729 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  76.63 
 
 
184 aa  306  6.999999999999999e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  75 
 
 
184 aa  297  6e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  77.72 
 
 
184 aa  289  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  46.63 
 
 
181 aa  170  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  43.1 
 
 
189 aa  166  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  46.54 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  44.3 
 
 
180 aa  139  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  44.12 
 
 
172 aa  135  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  37.87 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  40.34 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  40.68 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  37.79 
 
 
175 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  40.38 
 
 
192 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  37.11 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  38.41 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  39.74 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  40 
 
 
176 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  41.51 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  41.79 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  36.25 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  40.71 
 
 
178 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  35.76 
 
 
182 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  40 
 
 
178 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  37.14 
 
 
180 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  39.29 
 
 
178 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  40.77 
 
 
174 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  36.11 
 
 
204 aa  97.8  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  36.25 
 
 
203 aa  91.3  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  33.33 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  26.14 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  28.49 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  29.38 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  28.85 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  28.75 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  27.5 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  25.9 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  28.64 
 
 
225 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  25 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  25.41 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  29.44 
 
 
268 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  26.13 
 
 
219 aa  54.7  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  28.19 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  23.81 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  25.22 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  25.13 
 
 
252 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  27.42 
 
 
228 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  27.42 
 
 
228 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  27.42 
 
 
228 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  23.92 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4881  hypothetical protein  26.54 
 
 
216 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  28.64 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  25.33 
 
 
229 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  24.14 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  22.32 
 
 
514 aa  49.3  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  24.53 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  26.34 
 
 
225 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  24.73 
 
 
233 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  26.34 
 
 
243 aa  47.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  25.97 
 
 
218 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  27.31 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  23.74 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  25.77 
 
 
203 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  22.69 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  25.84 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  24.55 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  24.55 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  24.55 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  24.55 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  24.55 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  30.23 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  28.25 
 
 
273 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  22.99 
 
 
511 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  23.3 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  26.09 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  25.56 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  25.53 
 
 
255 aa  45.1  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  27.51 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  25.12 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  22.46 
 
 
511 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  27.98 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  27.98 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  26.84 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  45.45 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  24.66 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  24.41 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  26.14 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  27.19 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  23.38 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  26.48 
 
 
269 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>